Det skjer bare timer etter at president Lansana Conte døde tirsdag, melder nyhetsbyrået AP.
Kaptein Moussa Dadis Camara opplyser i en radiomelding at en gruppe med sivile og militære ledere vil overta makten.
- De statlige institusjonene er uskikket til å løse den pågående krisen i landet, sier Camara.
- Regjeringen og institusjonene i republikken er oppløst, sier han.
Den avdøde presidenten Lansana Conte har styrt landet med jernhånd siden 1984.
Dødsårsaken til presidenten er ennå ukjent, men han skal ha lidd av diabetes i lang tid.
Etter at dødsfallet ble kjent, kom statsminister Ahmed Tidiane Souare med en appell til folket hvor han ba dem om å bevare roen. I tillegg erklærte han landesorg i 40 dager, melder BBC.
- Jeg ber alle forsvars- og sikkerhetsstyrker om å verne om sikkerheten langs våre grenser og bevare roen inne på nasjonalt territorium som en hyllest til vår strålende avdøde leder, sa han.